La flora intestinal o microbiota es un complejo ecosistema compuesto por billones de microorganismos, fundamentalmente bacterias, unas beneficiosas y otras patógenas, que mantienen un equilibrio en nuestro aparato digestivo.
Viven en simbiosis con nuestro organismo, su genoma interacciona con el nuestro, y sus funciones son tan importantes para la salud que se puede considerar como un órgano más del que no podemos prescindir.